Àrea de Microbiota
Estudi de l’impacte del microbioma i del trasplantament de microbiota en la salut humana
Caracterització del micobioma mitjançant amplificació i seqüènciació del gen 16S rRNA
La caracterització de la fracció bacteriana del microbioma de diferents tipus de mostres (femtes, frotis rectals, frotis vaginals, mostres respiratòries…) es fa mitjançant amplificació i seqüenciació del gen 16S rRNA a través de la tecnologia Illumina. Aquest procés inclou l’extracció del material genètic de la mostra, la preparació de llibreries i la seqüenciació.
Caracterització del micobioma i resistoma mitjançant tecnologia d'amplicons
La caracterització de la fracció bacteriana del microbioma i el resistoma de diferents tipus de mostres (femtes, frotis rectals, frotis vaginals, mostres respiratòries…) es fa mitjançant l’amplificació i seqüenciació d’un panell d’amplicons que inclou diferents regions variables del gen 16S rRNA així com més de 350 gens de resistència a antibiòtics diferents, mitjançant la tecnologia de seqüenciació IonTorrent.
Anàlisi bionformàtic de les seqüències
Es realitza un processament bioinformàtic de les seqüències obtingudes a través de les diferents plataformes de seqüenciació. Aquest processament consisteix en analitzar la qualitat de les seqüències i filtrar-les, realitzar diferents processos de normalització per tal d’obtenir resultats comparables així com realitzar l’assignació taxonòmica i obtenir la relació filogenètica entre els diferents taxons identificats.
Anàlisi estadístic de les dades obtingudes
A partir de les seqüències processades es calculen els diferents índex d’alfa i beta diversitat i es realitzen anàlisis d’abundància diferencial en relació als principals grups d’interès de cada estudi. Addicionalment, es proporciona suport en la interpretació de les dades obtingudes.
Actualitat
Des del juny, Catalunya ha registrat 40 casos d’arbovirosi importats, principalment de dengue i chikungunya. Les autoritats sanitàries alerten sobre l’expansió global d’aquests virus transmesos per mosquits, impulsada pel canvi climàtic i la mobilitat internacional. Experts del Clínic subratllen la importància de la vigilància i el diagnòstic precoç per anticipar futurs brots, com en el cas del virus USUTU.
El Banc de Microbiota Fecal de Catalunya, creat al 2023 per l’Hospital Clínic juntament amb l’Hospital Universitari de Bellvitge i amb la participació de l’Organització Catalana de Trasplantaments (OCATT) i el Banc de Sang i Teixits (BST), ja està en funcionament.
- FLASH CDB
En el camp de l’endocrinologia el resultat de les proves que es realitzen als laboratoris permeten diagnosticar més del 80% dels trastorns hormonals i, per tant, són fonamentals per monitoritzar i ajustar els tractaments en malalties com l'hipotiroïdisme, la diabetis o la síndrome d'ovari poliquístic.