Bases moleculars de la resistència als antibiòtics en bacteris multiresistents
Línea de investigación
Jordi Vila
Especialista en Bacteriologia
Cristina Pitart
Facultatiu de la Secció de Bacteriologia
Presentació
Problema
L'increment de les infeccions ocasionades per bacteris multiresistents és un problema de salut global. Els bacteris multiresistents (resistents a més de dos antibiòtics), amb resistència estesa (resistents a tots els antibiòtics, excepte a dues classes) i panresistents (resistents a tots els antibiòtics comercialitzats) estan augmentat progressivament en les últimes dècades. ;
Aproximació
El nostre grup pretén fer una vigilància activa no només a nivell de bacteris multiresistents causants d'infeccions intrahospitalàries sinó els que poden causar infeccions comunitàries. L'estudi dels mecanismes de resistència ens permet conèixer si estan localitzats en elements genètics mòbils amb capacitat de ser transmesos a altres bacteris.
Impacte
La identificació ràpida del bacteri causant de la infecció, així com els seus determinants de resistència, ens permetrà administrar una teràpia antimicrobiana més adequada, amb la potencial disminució de la mortalitat associada al mal ús d'antibiòtics. La caracterització ràpida de la relació epidemiològica entre els ceps ens permet determinar si estem davant d'un potencial brot epidèmic. A més, ens permet caracteritzar els clons d'alt risc. La investigació dels mecanismes de resistència afavorirà el coneixement dels determinants de resistència que estan circulant, així com la seva localització genètica i així evitar-ne la potencial disseminació.
Membres de l'equip
Cristina Pitart
Francesc Marc
Ignasi Roca
Mateu Espasa
Jordi Bosch
Andrea Vergara
Publicacions
Wernli D, Jørgensen PS, Parmley EJ, Troell M, Majowicz S, Harbarth S, Léger A, Lambraki I, Graells T, Henriksson PJG, Carson C, Cousins M, Skoog Ståhlgren G, Mohan CV, Simpson AJH, Wieland B, Pedersen K, Schneider A, Chandy SJ, Wijayathilaka TP, Delamare-Deboutteville J, Vila J, Stålsby Lundborg C, Pittet D. Evidence for action: a One Health learning platform on interventions to tackle antimicrobial resistance. Lancet Infectious Diseases (2020) Aug 24:S1473-3099(20)30392-3. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30392-3. Online ahead of print.
Pons MJ, Marí-Almirall M, Ymaña B, Moya-Salazar J, Muñoz L, Sauñe S, Salazar-Hernández R, Vila J, Roca I. Spread of ST348 Klebsiella pneumoniae Producing NDM-1 in a Peruvian Hospital. Microorganisms (2020) Sep 11;8(9): E1392. doi: 10.3390/microorganisms8091392.
Mandomando I, Vubil D, Boisen N, Quinto L, Ruiz J, Sigauque B, Nhampossa T, Garrine M, Massora S; Aide P, Pons MJ, Bassat Q, Vila J, Macete E, Levine MM, Nataro JP, Alonso P. Escherichia coli ST131 clones harbouring AggR and AAF/V fimbriae causing bacteremia in Mozambican children: Emergence of new variant of fimH27subclone. PLoS Neglected Tropical Diseases (2020) 14(5): e0008274. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0008274.
Vergara A, Moreno-Morales J, Roca I, Pitart C, Kostyanev T, Rodriguez-Baño J, Goossens H, Marco F, Vila J. A comparative study between real-time PCR and loop-mediated isothermal amplification to detect carbapenemase and/or ESBL genes Enterobacteriaceae directly from bronchoalveolar lavage fluid samples. Journal of Antimicrobial Chemotherapy (2020) Feb 19. pii: dkaa031. doi: 10.1093/jac/dkaa031.
Cabrera R, Fernández-Barat L, Motos A, López-Aladid R, Vázquez N, Panigada M, Álvarez-Lerma F, López Y, Muñoz L, Castro P, Vila J, Torres A. Molecular characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus clinical strains from the endotracheal tubes of patients with nosocomial pneumoniae. Antimicrobial Resistance and Infection Control. (2020) Feb 28;9(1):43. doi: 10.1186/s13756-020-0679-z.
Vergara A, Boutal H, Ceccato A, López M, Cruells A, Bueno-Freire L, Moreno-Morales J, Puig de la Bellacasa J, Castro P, Torres A, Marco F, Casals-Pascual C, Vila J. Assessment of a loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assay for the Rapid Detection of Pathogenic Bacteria from Respiratory Samples in Patients with Hospital-Acquired Pneumonia. Microorganisms. 2020 Jan 11;8(1). pii: E103. doi: 10.3390/microorganisms8010103.
Guiral E, Quiles MG, Muñoz L, Moreno-Morales J, Alejo-Cancho I, Salvador P, Alvarez-Martinez MJ, Marco F, Vila J. Emergence of resistance to quinolones and β-lactam antibiotics in enteroaggregative and enterotoxigenic Escherichia coli causing traveler's diarrhea. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (2019) 63: e01745
Gerson S, Betts JW, Lucaßen K, Nodari CS, Wille J, Josten M, Göttig S, Nowak J, Stefanik D, Roca I, Vila J, Cisneros JM, La Ragione RM, Seifert H, Higgins PG. Investigation of novel pmrB and eptA mutations in isogenic Acinetobacter baumannii isolates associated with colistin resistance and increased virulence in vivo. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (2019) 63: e01586-18.
Yuliya Zboromyrska, Catia Cillóniz, Nazaret Cobos-Trigueros, Manel Almela, Juan Carlos Hurtado, Andrea Vergara, Caterina Mata, Alex Soriano, Josep Mensa, Francesc Marco and Jordi Vila. Evaluation of the MagicplexTM Sepsis Real-Time Test for the Rapid Diagnosis of Bloodstream Infections in Adults. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (2019) 9: 56. doi: 10.3389/fcimb.2019.00056.
Rubio E, Zboromyrska Y, Bosch J, Fernandez-Pittol MJ, Fidalgo BI, Fasanella A, Mons A, Román A, Casals-Pascual C, Vila J. Evaluation of flow cytometry for the detection of bacteria in biological fluids. PLoS One (2019) Aug 7;14(8):e0220307.
Principals prestacions utilitzades
Soca bacteriana. Detecció de BLEE tipus CTX-M (lateral flow)
Altres línies estratègiques de recerca
El radó és la segona causa de càncer de pulmó, després del consum de cigarretes. En aquesta indagació volem investigar els mecanismes de carcinogènesi molecular i immunologia vinculats a l'exposició al gas radó en pacients amb càncer de pulmó de cèl·lula no petita.
Desenvolupament d'un panell de seqüenciació massiva (NGS) a leucèmia limfocítica crònica.
Els càncers de vulva independents de VPH semblen ser més agressius que els tumors associats al VPH i, dins dels tumors VPH-independents, aquells amb alteracions de p53 semblen tenir més agressivitat. Infeliçment, són pràcticament inexistents els estudis en què s'analitzin i es comparin les característiques moleculars d'aquests tumors.
El carcinoma colorectal en estadis inicials pot tenir micrometàstasi als ganglis limfàtics, no detectables mitjançant l’anàlisi histològic convencional.
El servei d'Anatomia Patològica està en constant actualització i innovació. La implementació de noves tecnologies complementàries al diagnòstic convencional s'estudia activament per a proporcionar els millors diagnòstics als nostres pacients.
Les malalties minoritàries d’origen genètic representen actualment greus problemes de salut. El nostre grup aborda aquesta qüestió des d'una perspectiva multidisciplinar per millorar el diagnòstic i el seu tractament.
Una resposta inflamatòria excessiva juga un paper clau en el desenvolupament de les complicacions hepàtiques. El nostre laboratori investiga com combatre aquesta inflamació promovent la formació de lípids que promouen la resolució de la inflamació.
Actualment, una de cada cinc parelles pateix problemes de fertilitat. El nostre grup, aborda aquesta qüestió principalment des del punt de vista del factor masculí, i des de un punt de vista multi-òmic amb l'objectiu de descobrir els mecanismes fonamentals necessaris per a la fertilitat masculina i identificar noves causes moleculars de la infertilitat.
Determinades malalties hematològiques, com són les leucèmies i limfomes, són malalties greus que poden aparèixer a totes les edats i la prevalença de les quals augmenta amb l'edat.
Les neoplàsies humanes i les malalties inflamatòries tenen uns mecanismes genètics i moleculars implicats en el seu desenvolupament i progressió que es poden conèixer mitjançant tècniques moleculars i digitals aplicades als teixits.
El grup treballa per entendre els mecanismes moleculars implicats en el desenvolupament i la progressió de les neoplàsies limfoides.
Les malalties metabòliques hereditàries (MMH) són malalties rares monogèniques que afecten el metabolisme causant una alta morbimortalitat. Els avenços tecnològics permeten identificar noves patologies i biomarcadors. No es disposa de tractament per a totes les MMH, per la qual cosa es requereix la recerca de noves teràpies.
L’objectiu d’aquesta de recerca es el disseny i desenvolupament de nous agents antibacterians actius en front de bacteris multiresistents. Hem desenvolupat dues línies: 1. Pèptids cíclics amb activitat antibacteriana i 2. Reposicionament de agents antiretrovirals com a agents antibacterians. Es disposa de tres patents.
L’objectiu d’aquesta àrea de recerca és la detecció dels clons de bacteris multi resistents que circulen per el nostre medi i la identificació dels mecanismes moleculars que causen la multi resistència.
Els gens (base del funcionament dels organismes vius) també defineixen el sistema immunitari i, per tant, també la majoria de malalties humanes.
Els tractaments davant de patògens com el VIH, virus de les hepatitis, virus de la grip o citomegalovirus poden veure's afectats pel desenvolupament de mutacions virals que confereixen resistència a un determinat fàrmac o grup de fàrmacs.
Actualment, la supervivència dels pacients trasplantats de fetge als cinc anys és entre un 70%-80%. Una esperança que, en gran mesura, està condicionada pels efectes de l'envelliment i el tractament immunosupressor.
Les malalties hepàtiques i cardíaques representen actualment greus problemes de salut. El nostre grup aborda aquesta qüestió des d'una perspectiva multifactorial, utilitzant la biologia molecular, la recerca en biomarcadors sanguinis i la nanomedicina per a identificar eines diagnostiques i terapèutiques en aquestes malalties.