Identificació de mutacions somàtiques implicades en els mecanismes de sensibilitat i/o resistència a fàrmacs dirigits a tumors sòlids
Línea de investigación
Míriam Cuatrecasas
Facultativa i Consultora de Patologia Digestiva
Presentació
Problema
Les neoplàsies humanes i les malalties inflamatòries tenen uns mecanismes genètics i moleculars implicats en el seu desenvolupament i progressió que es poden conèixer mitjançant tècniques moleculars i digitals aplicades als teixits.
Aproximació
Les plataformes tecnològiques aplicades a la investigació de les malalties inflamatòries i els tumors humans permeten transferir a la pràctica clínica els coneixements generats en la investigació bàsica.
Per aquest motiu, a nivell diagnòstic s'utilitzen tècniques de patologia molecular aplicades, que inclouen genètica, epigenètica, proteòmica, glicòmica i patologia digital amb algorismes d'intel·ligència artificial, microscòpia espectral i confocal ex vivo.
Impacte
Gràcies a la identificació de dianes terapèutiques, el grup ha distingit paràmetres que permeten millorar el diagnòstic i el pronòstic de la malaltia inflamatòria i neoplàstica.
El grup és líder en diagnòstic molecular de carcinoma de pulmó, mama i estadificació molecular ganglionar en càncer colorectal, així com en mecanismes moleculars subjacents als processos inflamatoris cutanis i renals, tècniques de caracterització molecular en melanoma i tumors del sistema nerviós central .
Membres de l'equip
Miriam Cuatrecasas
Iban Aldecoa
Llucia Alos
Paola Cecilia Castell Fernández
Adriana García-Herrera
Carme Mallofre
Alfons Nadal
José Francisco Ramírez
Teresa Ribalta
Adela Saco
Sherley Diaz
Esther Sanfeliu
Cristina Teixit
Publicacions
Griguolo G, Brasó-Maristany F, González-Farré B, Pascual T, Chic N, Saurí T, Kates R, Gluz O, Martínez D, Paré L, Tsvetkova V, Pesantez D, Vidal M, Adamo B, Muñoz M, Galván P, Barberá L,Cuatrecasas M, Christgen M, Kreipe H, Monge-Escartín I, Villagrasa P, Soy D, Giarratano T, Dieci MV, Conte P, Harbeck N, Guarneri V, Prat A. Cancers (Basel). 2020 Jul 14;12(7):1902. doi: 10.3390/cancers12071902.
Marin E, Teixido C, Carmona-Rocha E, Reyes R, Arcocha A, Viñolas N, Rodríguez-Mues M, Cabrera C, Sánchez M, Vollmer I, Castillo S, Muñoz S, Sullivan IG, Rodriguez A, Garcia M, Alos S, Jares P, Martinez A, Prat A, Molina-Vila MÁ, Reguart N. Cancers (Basel). 2020 Apr 30;12(5):1124. doi: 10.3390/cancers12051124.
Díaz-Gay M, Franch-Expósito S, Arnau-Collell C, Park S, Supek F, Muñoz J, Bonjoch L, Gratacós-Mulleras A, Sánchez-Rojas PA, Esteban-Jurado C, Ocaña T, Cuatrecasas M, Vila-Casadesús M, Lozano JJ, Parra G, Laurie S, Beltran S; EPICOLON Consortium, Castells A, Bujanda L, Cubiella J, Balaguer F, Castellví-Bel S.Cancers (Basel). 2019 Mar 13;11(3):362. doi: 10.3390/cancers11030362.
AURKB as a target in non-small cell lung cancer with acquired resistance to anti-EGFR therapy.
Bertran-Alamillo J, Cattan V, Schoumacher M, Codony-Servat J, Giménez-Capitán A, Cantero F, Burbridge M, Rodríguez S, Teixidó C, Roman R, Castellví J, García-Román S, Codony-Servat C, Viteri S, Cardona AF, Karachaliou N, Rosell R, Molina-Vila MA.Nat Commun. 2019 Apr 18;10(1):1812. doi: 10.1038/s41467-019-09734-5.
Conde E, Hernandez S, Martinez R, Angulo B, De Castro J, Collazo-Lorduy A, Jimenez B, Muriel A, Mate JL, Moran T, Aranda I, Massuti B, Rojo F, Domine M, Sansano I, Garcia F, Felip E, Mancheño N, Juan O, Sanz J, Gonzalez-Larriba JL, Atienza-Cuevas L, Arriola-Arellano E, Abdulkader I, Garcia-Gonzalez J, Camacho C, Rodriguez-Abreu D, Teixido C, Reguart N, Gonzalez-Piñeiro A, Lazaro-Quintela M, Lozano MD, Gurpide A, Gomez-Roman J, Lopez-Brea M, Pijuan L, Salido M, Arriola E, Company A, Insa A, Esteban-Rodriguez I, Saiz M, Azkona E, Alvarez R, Artal A, Plaza ML, Aguiar D, Enguita AB, Benito A, Paz-Ares L, Garrido P, Lopez-Rios F.J Thorac Oncol. 2019 Dec;14(12):2120-2132. doi: 10.1016/j.jtho.2019.07.005.
Kandimalla R, Ozawa T, Gao F, Wang X, Goel A; T1 Colorectal Cancer Study Group.Gastroenterology. 2019 Jun;156(8):2338-2341.e3. doi: 10.1053/j.gastro.2019.02.027.
Reyes R, Mayo-de-Las-Casas C, Teixidó C, Cabrera C, Marín E, Vollmer I, Jares P, Garzón M, Molina-Vila MÁ, Reguart N.Clin Lung Cancer. 2019 May;20(3):e219-e223. doi: 10.1016/j.cllc.2019.02.022.
DYRK1A modulates c-MET in pancreatic ductal adenocarcinoma to drive tumour growth.
Luna J, Boni J, Cuatrecasas M, Bofill-De Ros X, Núñez-Manchón E, Gironella M, Vaquero EC, Arbones ML, de la Luna S, Fillat C.Gut. 2019 Aug;68(8):1465-1476. doi: 10.1136/gutjnl-2018-316128.
Aldecoa I, Montironi C, Vargas GM, Nunes DA, Miquel R, Cuatrecasas M.Gastroenterol Hepatol. 2019 Jun-Jul;42(6):374-375. doi: 10.1016/j.gastrohep.2018.08.006.
Puig I, López-Cerón M, Arnau A, Rosiñol Ò, Cuatrecasas M, Herreros-de-Tejada A, Ferrández Á, Serra-Burriel M, Nogales Ó, Vida F, de Castro L, López-Vicente J, Vega P, Álvarez-González MA, González-Santiago J, Hernández-Conde M, Díez-Redondo P, Rivero-Sánchez L, Gimeno-García AZ, Burgos A, García-Alonso FJ, Bustamante-Balén M, Martínez-Bauer E, Peñas B, Pellise M, EndoCAR group, Spanish Gastroenterological Association and the Spanish Digestive Endoscopy Society.
Gastroenterology. 2019 Jan;156(1):75-87. doi: 10.1053/j.gastro.2018.10.004.
DYRK1A modulates c-MET in pancreatic ductal adenocarcinoma to drive tumour growth
Luna J; Boni J; Cuatrecasas M; Bofill-De Ros X; Núñez-Manchón E; Gironella M; Vaquero EC; Arbones ML; De La Luna S; Fillat C.
Gut. 2019 Aug;68(8):1465-1476. doi: 10.1136/gutjnl-2018-316128.
Liu Y; Siles L; Lu X; Dean K; Cuatrecasas M; Postigo A; Dean D.
Nat Commun. 2018 Jun 21;9(1):2424. doi: 10.1038/s41467-018-04663-1.
Wangsa D, Quintanilla I, Torabi K, Vila-Casadesús M, Ercilla A, Klus G, Yuce Z, Galofré C, Cuatrecasas M, Lozano JJ, Agell N, Cimini D, Castells A, Ried T, Camps J .
FASEB J. 2018 Jul;32(7):3502-3517. doi: 10.1096/fj.201700247RR.
Franch-Expósito S, Esteban-Jurado C, Garre P, Quintanilla I, Duran-Sanchon S, Díaz-Gay M, Bonjoch L, Cuatrecasas M, Samper E, Muñoz J, Ocaña T, Carballal S, López-Cerón M, Castells A,, Vila-Casadesús M, Derdak S, Laurie S, Beltran S, Carvajal J, Bujanda L, Ruiz-Ponte C, Camps J, Gironella M, Lozano JJ, Balaguer F, Cubiella J, Caldés T, Castellví-Bel S EPICOLON consortium.
J Genet Genomics. 2018 Jan 20;45(1):41-45. doi: 10.1016/j.jgg.2017.12.001.
Rutter MD, Beintaris I, Valori R, Chiu HM, Corley DA, Cuatrecasas M, Dekker E, Forsberg A, Gore-Booth J, Haug U, Kaminski MF, Matsuda T, Meijer GA, Morris E, Plumb AA, Rabeneck L, Robertson DJ, Schoen RE, Singh H, Tinmouth J, Young GP, Sanduleanu S .
Gastroenterology. 2018 Sep;155(3):909-925.e3. doi: 10.1053/j.gastro.2018.05.038.
Rakislova N., Montironi C., Aldecoa I., Fernandez E., Bombi J., Jimeno M., Balaguer F., Pellise M., Castells A., Cuatrecasas M.
J Transl Med. 2017 Jan 14;15(1):14. doi: 10.1186/s12967-016-1114-3.
Aldecoa I, Montironi C, Planell N, Pellise M, Fernandez-Esparrach G, Gines A, Delgado S, Momblan D, Moreira L, Lopez-Ceron M, Rakislova N, Martinez-Palli G, Balust J, Bombi JA, de Lacy A, Castells A, Balaguer F, Cuatrecasas M.
Surg Endosc. 2017 Feb;31(2):723-733. doi: 10.1007/s00464-016-5026-3.
Increased IFRD1 Expression in Human Colon Cancers Predicts Reduced Patient Survival.
Lewis MA, Sharabash N, Miao ZF, Lyons LN, Piccirillo J, Kallogjeri D, Schootman M, Mutch M, Yan Y, Levin MS, Castells A, Cuatrecasas M, Mills JC, Wang ZN, Rubin DC.
Dig Dis Sci. 2017 Dec;62(12):3460-3467. doi: 10.1007/s10620-017-4819-0.
Principals prestacions utilitzades
Anàlisi de les mutacions de BRAF, teixits
Anàlisi de les mutacions d'EGFR, teixit
Anàlisi de les mutacions de KRAS, teixit
Anàlisi MGMT per a tumors cerebrals, teixits
CISH. Virus Epstein-Barr (EBER), bloc parafina
Detecció del Virus del Papil·loma Humà (VPH) per PCR, mostra citològica o teixit parafinat
Determinació de la inestabilitat en microsatèl·lits en tumors sòlids
Determinació de mutacions de C-KIT, bloc parafina
Determinació de mutacions d'IDH1, bloc parafina
Determinació de mutacions d'IDH2, bloc parafina
Determinació de mutacions del gen PDGFRA, bloc parafina
Determinació de mutacions del promotor de TERT, bloc parafina
Determinació gens de fusió de pulmó per nCounter (Nanostring)
Determinació per tècnica OSNA
Extracció de DNA / RNA, bloc de parafina
FISH ALK, bloc de parafina
FISH MDM2, bloc de parafina
FISH MET, bloc de parafina
FISH ROS1, bloc de parafina
FISH 1p/19q tumors cerebrals, bloc parafina
HER2 (Immunohistoquímica), bloc parafina
ISH HER2, bloc parafina
Microsatèl·lits MSH2, MSH6, MLH1, PMS2 (Immunohistoquímica)
P16 en teixit (Immunohistoquímica), bloc parafina
Panell Oncomine Solid Tumor 22 (NGS), DNA tumoral
Test Prosigna, teixit tumoral de mama parafinat
Altres línies estratègiques de recerca
El radó és la segona causa de càncer de pulmó, després del consum de cigarretes. En aquesta indagació volem investigar els mecanismes de carcinogènesi molecular i immunologia vinculats a l'exposició al gas radó en pacients amb càncer de pulmó de cèl·lula no petita.
Desenvolupament d'un panell de seqüenciació massiva (NGS) a leucèmia limfocítica crònica.
Els càncers de vulva independents de VPH semblen ser més agressius que els tumors associats al VPH i, dins dels tumors VPH-independents, aquells amb alteracions de p53 semblen tenir més agressivitat. Infeliçment, són pràcticament inexistents els estudis en què s'analitzin i es comparin les característiques moleculars d'aquests tumors.
El carcinoma colorectal en estadis inicials pot tenir micrometàstasi als ganglis limfàtics, no detectables mitjançant l’anàlisi histològic convencional.
El servei d'Anatomia Patològica està en constant actualització i innovació. La implementació de noves tecnologies complementàries al diagnòstic convencional s'estudia activament per a proporcionar els millors diagnòstics als nostres pacients.
Les malalties minoritàries d’origen genètic representen actualment greus problemes de salut. El nostre grup aborda aquesta qüestió des d'una perspectiva multidisciplinar per millorar el diagnòstic i el seu tractament.
Una resposta inflamatòria excessiva juga un paper clau en el desenvolupament de les complicacions hepàtiques. El nostre laboratori investiga com combatre aquesta inflamació promovent la formació de lípids que promouen la resolució de la inflamació.
Actualment, una de cada cinc parelles pateix problemes de fertilitat. El nostre grup, aborda aquesta qüestió principalment des del punt de vista del factor masculí, i des de un punt de vista multi-òmic amb l'objectiu de descobrir els mecanismes fonamentals necessaris per a la fertilitat masculina i identificar noves causes moleculars de la infertilitat.
Determinades malalties hematològiques, com són les leucèmies i limfomes, són malalties greus que poden aparèixer a totes les edats i la prevalença de les quals augmenta amb l'edat.
Les neoplàsies humanes i les malalties inflamatòries tenen uns mecanismes genètics i moleculars implicats en el seu desenvolupament i progressió que es poden conèixer mitjançant tècniques moleculars i digitals aplicades als teixits.
El grup treballa per entendre els mecanismes moleculars implicats en el desenvolupament i la progressió de les neoplàsies limfoides.
Les malalties metabòliques hereditàries (MMH) són malalties rares monogèniques que afecten el metabolisme causant una alta morbimortalitat. Els avenços tecnològics permeten identificar noves patologies i biomarcadors. No es disposa de tractament per a totes les MMH, per la qual cosa es requereix la recerca de noves teràpies.
L’objectiu d’aquesta de recerca es el disseny i desenvolupament de nous agents antibacterians actius en front de bacteris multiresistents. Hem desenvolupat dues línies: 1. Pèptids cíclics amb activitat antibacteriana i 2. Reposicionament de agents antiretrovirals com a agents antibacterians. Es disposa de tres patents.
L’objectiu d’aquesta àrea de recerca és la detecció dels clons de bacteris multi resistents que circulen per el nostre medi i la identificació dels mecanismes moleculars que causen la multi resistència.
Els gens (base del funcionament dels organismes vius) també defineixen el sistema immunitari i, per tant, també la majoria de malalties humanes.
Els tractaments davant de patògens com el VIH, virus de les hepatitis, virus de la grip o citomegalovirus poden veure's afectats pel desenvolupament de mutacions virals que confereixen resistència a un determinat fàrmac o grup de fàrmacs.
Actualment, la supervivència dels pacients trasplantats de fetge als cinc anys és entre un 70%-80%. Una esperança que, en gran mesura, està condicionada pels efectes de l'envelliment i el tractament immunosupressor.
Les malalties hepàtiques i cardíaques representen actualment greus problemes de salut. El nostre grup aborda aquesta qüestió des d'una perspectiva multifactorial, utilitzant la biologia molecular, la recerca en biomarcadors sanguinis i la nanomedicina per a identificar eines diagnostiques i terapèutiques en aquestes malalties.