Recerca translacional en noves estratègies diagnòstiques en malalties minoritàries d’origen genètic
Línea de investigación
Celia Badenas Orquin
Especialista en el Servei de Bioquímica i Genètica Molecular
Presentació
Problema
Les malalties minoritàries són un grup molt nombrós de malalties integrat per més de 7.000 condicions clíniques que pateixen un nombre limitat de persones en relació amb el conjunt de la població (<5 casos/10.000 persones). Tot i ser minoritàries, en conjunt poden afectar entre 5-7% de la població general i a Catalunya s’estima que hi ha unes 350.000 persones afectades. Les malalties minoritàries són molt heterogènies i això fa que hi hagi escassetat en el seu coneixement, diagnòstic i tractament.
Aproximació
El nostre grup aborda aquest problema des d'una perspectiva multidisciplinar i estructurada en tres principals vessants: el diagnòstic molecular i citogenètic i el consell genètic en l’àmbit tant prenatal com postnatal. Les vessants van dirigides a la caracterització de les bases genètiques de les malalties minoritàries com és el cas dels trastorns del neurodesenvolupament, la porfíria i d’altres genodermatosis, les patologies associades a la expansió del gen FMR1 o els reordenaments cromosòmics. L’objectiu final és assolir una medicina de precisió que permeti establir una correlació genotip-fenotip de les alteracions identificades i trobar implicacions que beneficiïn el diagnòstic, tractament i seguiment dels pacients.
Impacte
Facilitar el desplegament efectiu de la Medicina de Precisió en les malalties minoritàries assegurant la qualitat cientificotècnica i l'eficiència en la utilització dels recursos científics disponibles per donar resposta a les necessitats dels pacients i familiars.
Membres de l'equip
Celia Badenas
Maria Isabel Álvarez-Mora
Irene Madrigal
Esther Margarit
Josep Oriola
Miriam Potrony
Laia Rodríguez-Revenga
Aurora Sánchez
Edgard Verdura
Publicacions
Agusti I, Alvarez-Mora MI, Wijngaard R, Borras A, Barcos T, Peralta S, Guimera M, Goday A, Manau D, Rodriguez-Revenga L. Correlation of FMR4 expression levels to ovarian reserve markers in FMR1 premutation carriers. J Ovarian Res. 2024 May 17;17(1):103. doi: 10.1186/s13048-024-01425-0.
Lasa-Aranzasti A, Larasati YA, da Silva Cardoso J, Solis GP, Koval A, Cazurro-Gutiérrez A, Ortigoza-Escobar JD, Miranda MC, De la Casa-Fages B, Moreno-Galdó A, Tizzano EF, Gómez-Andrés D, Verdura E, Katanaev VL, Pérez-Dueñas B; Study Group of GNAO1 patients from Spain. Clinical and Molecular Profiling in GNAO1 Permits Phenotype-Genotype Correlation. Mov Disord. 2024 Jun 16. doi: 10.1002/mds.29881.
Asla Q, Sardà H, Seguí N, Martínez de Pinillos G, Mazarico-Altisent I, Capel I, Rives J, Suárez J, Ávila-Rubio V, Muñoz Torres M, Saigí I, Palacios N, Urgell E, Webb SM, Fernández M, Oriola J, Mora M, Tondo M, Aulinas A. Clinical and outcome comparison of genetically positive vs. negative patients in a large cohort of suspected familial hypocalciuric hypercalcemia. Endocrine. 2024 Mar;83(3):747-756. doi: 10.1007/s12020-023-03560-y. Epub 2023 Oct 30.
Mauri S, Nieto-Moragas J, Obón M, Oriola J. The Glucocorticoid Resistance Syndrome. Two Cases of a Novel Pathogenic Variant in the Glucocorticoid Receptor Gene. JCEM Case Rep. 2024 Jan 2;2(1):luad153. doi: 10.1210/jcemcr/luad153. eCollection 2024 Jan.
Álvarez-Mora MI, Garrabou G, Molina-Porcel L, Grillo-Risco R, Garcia-Garcia F, Barcos T, Cantó-Santos J, Rodriguez-Revenga L. Exploration of SUMO2/3 Expression Levels and Autophagy Process in Fragile X-Associated Tremor/Ataxia Syndrome: Addressing Study Limitations and Insights for Future Research. Cells. 2023 Sep 26;12(19):2364. doi: 10.3390/cells12192364.
Álvarez-Mora MI, Rodríguez-Revenga L, Jodar M, Potrony M, Sanchez A, Badenas C, Oriola J, Villanueva-Cañas JL, Muñoz E, Valldeoriola F, Cámara A, Compta Y, Carreño M, Martí MJ, Sánchez-Valle R, Madrigal I. Implementation of Exome Sequencing in Clinical Practice for Neurological Disorders. Genes (Basel). 2023 Mar 28;14(4):813. doi: 10.3390/genes14040813.
Cioclu MC, Mosca I, Ambrosino P, Puzo D, Bayat A, Wortmann SB, Koch J, Strehlow V, Shirai K, Matsumoto N, Sanders SJ, Michaud V, Legendre M, Riva A, Striano P, Muhle H, Pendziwiat M, Lesca G, Mangano GD, Nardello R; KCNT2-study group; Lemke JR, Møller RS, Soldovieri MV, Rubboli G, Taglialatela M. KCNT2-Related Disorders: Phenotypes, Functional, and Pharmacological Properties. Ann Neurol. 2023 Aug;94(2):332-349. doi: 10.1002/ana.26662. Epub 2023 May 22.
Pellegrini C, Cardelli L, Ghiorzo P, Pastorino L, Potrony M, García-Casado Z, Elefanti L, Stefanaki I, Mastrangelo M, Necozione S, Aguilera P, Rodríguez-Hernández A, Di Nardo L, Rocco T, Del Regno L, Badenas C, Carrera C, Malvehy J, Requena C, Bañuls J, Stratigos AJ, Peris K, Menin C, Calista D, Nagore E, Puig S, Landi MT, Fargnoli MC. High- and intermediate-risk susceptibility variants in melanoma families from the Mediterranean area: A multicentre cohort from the MelaNostrum Consortium. J Eur Acad Dermatol Venereol. 2023 Dec;37(12):2498-2508. doi: 10.1111/jdv.19461. Epub 2023 Sep 5.
Mariño Z, Molera-Busoms C, Badenas C, Quintero-Bernabeu J, Torra M, Forns X, Artuch R. Benefits of using exchangeable copper and the ratio of exchangeable copper in a real-world cohort of patients with Wilson disease. J Inherit Metab Dis. 2023 Sep;46(5):982-991. doi: 10.1002/jimd.12639. Epub 2023 Jun 8.
Schlüter A, Vélez-Santamaría V, Verdura E, Rodríguez-Palmero A, Ruiz M, Fourcade S, Planas-Serra L, Launay N, Guilera C, Martínez JJ, Homedes-Pedret C, Albertí-Aguiló MA, Zulaika M, Martí I, Troncoso M, Tomás-Vila M, Bullich G, García-Pérez MA, Sobrido-Gómez MJ, López-Laso E, Fons C, Del Toro M, Macaya A; HSP/ataxia workgroup; Beltran S, Gutiérrez-Solana LG, Pérez-Jurado LA, Aguilera-Albesa S, de Munain AL, Casasnovas C, Pujol A. ClinPrior: an algorithm for diagnosis and novel gene discovery by network-based prioritization. Genome Med. 2023 Sep 7;15(1):68. doi: 10.1186/s13073-023-01214-2.
Bullich G, Matalonga L, Pujadas M, Papakonstantinou A, Piscia D, Tonda R, Artuch R, Gallano P, Garrabou G, González JR, Grinberg D, Guitart M, Laurie S, Lázaro C, Luengo C, Martí R, Milà M, Ovelleiro D, Parra G, Pujol A, Tizzano E, Macaya A, Palau F, Ribes A, Pérez-Jurado LA, Beltran S; Undiagnosed Rare Disease Program of Catalonia (URD-Cat) Consortium. Systematic Collaborative Reanalysis of Genomic Data Improves Diagnostic Yield in Neurologic Rare Diseases. J Mol Diagn. 2022 May;24(5):529-542. doi: 10.1016/j.jmoldx.2022.02.003.
Principals prestacions utilitzades
Exomes
Arrays
X fràgil
NIPT
Validacions RNA
Consulta Genètica Clínica
Altres línies estratègiques de recerca
El radó és la segona causa de càncer de pulmó, després del consum de cigarretes. En aquesta indagació volem investigar els mecanismes de carcinogènesi molecular i immunologia vinculats a l'exposició al gas radó en pacients amb càncer de pulmó de cèl·lula no petita.
Desenvolupament d'un panell de seqüenciació massiva (NGS) a leucèmia limfocítica crònica.
Els càncers de vulva independents de VPH semblen ser més agressius que els tumors associats al VPH i, dins dels tumors VPH-independents, aquells amb alteracions de p53 semblen tenir més agressivitat. Infeliçment, són pràcticament inexistents els estudis en què s'analitzin i es comparin les característiques moleculars d'aquests tumors.
El carcinoma colorectal en estadis inicials pot tenir micrometàstasi als ganglis limfàtics, no detectables mitjançant l’anàlisi histològic convencional.
El servei d'Anatomia Patològica està en constant actualització i innovació. La implementació de noves tecnologies complementàries al diagnòstic convencional s'estudia activament per a proporcionar els millors diagnòstics als nostres pacients.
Les malalties minoritàries d’origen genètic representen actualment greus problemes de salut. El nostre grup aborda aquesta qüestió des d'una perspectiva multidisciplinar per millorar el diagnòstic i el seu tractament.
Una resposta inflamatòria excessiva juga un paper clau en el desenvolupament de les complicacions hepàtiques. El nostre laboratori investiga com combatre aquesta inflamació promovent la formació de lípids que promouen la resolució de la inflamació.
Actualment, una de cada cinc parelles pateix problemes de fertilitat. El nostre grup, aborda aquesta qüestió principalment des del punt de vista del factor masculí, i des de un punt de vista multi-òmic amb l'objectiu de descobrir els mecanismes fonamentals necessaris per a la fertilitat masculina i identificar noves causes moleculars de la infertilitat.
Determinades malalties hematològiques, com són les leucèmies i limfomes, són malalties greus que poden aparèixer a totes les edats i la prevalença de les quals augmenta amb l'edat.
Les neoplàsies humanes i les malalties inflamatòries tenen uns mecanismes genètics i moleculars implicats en el seu desenvolupament i progressió que es poden conèixer mitjançant tècniques moleculars i digitals aplicades als teixits.
El grup treballa per entendre els mecanismes moleculars implicats en el desenvolupament i la progressió de les neoplàsies limfoides.
Les malalties metabòliques hereditàries (MMH) són malalties rares monogèniques que afecten el metabolisme causant una alta morbimortalitat. Els avenços tecnològics permeten identificar noves patologies i biomarcadors. No es disposa de tractament per a totes les MMH, per la qual cosa es requereix la recerca de noves teràpies.
L’objectiu d’aquesta de recerca es el disseny i desenvolupament de nous agents antibacterians actius en front de bacteris multiresistents. Hem desenvolupat dues línies: 1. Pèptids cíclics amb activitat antibacteriana i 2. Reposicionament de agents antiretrovirals com a agents antibacterians. Es disposa de tres patents.
L’objectiu d’aquesta àrea de recerca és la detecció dels clons de bacteris multi resistents que circulen per el nostre medi i la identificació dels mecanismes moleculars que causen la multi resistència.
Els gens (base del funcionament dels organismes vius) també defineixen el sistema immunitari i, per tant, també la majoria de malalties humanes.
Els tractaments davant de patògens com el VIH, virus de les hepatitis, virus de la grip o citomegalovirus poden veure's afectats pel desenvolupament de mutacions virals que confereixen resistència a un determinat fàrmac o grup de fàrmacs.
Actualment, la supervivència dels pacients trasplantats de fetge als cinc anys és entre un 70%-80%. Una esperança que, en gran mesura, està condicionada pels efectes de l'envelliment i el tractament immunosupressor.
Les malalties hepàtiques i cardíaques representen actualment greus problemes de salut. El nostre grup aborda aquesta qüestió des d'una perspectiva multifactorial, utilitzant la biologia molecular, la recerca en biomarcadors sanguinis i la nanomedicina per a identificar eines diagnostiques i terapèutiques en aquestes malalties.